Tο ερευνητικό έργο του Καθηγητή Ευστάθιου Μανιού, εστιάζεται στη μελέτη της αρτηριακής πίεσης και των αγγειακών εγκεφαλικών επεισοδίων. Οι κύριοι τομείς έρευνας περιλαμβάνουν:
- Αρτηριακή Πίεση: Μελέτη της επίδρασης του κιρκάδιου ρυθμού, της μεταβλητότητας της αρτηριακής πίεσης (BPV) και των ειδικών φαινοτύπων αρτηριακής πίεσης στην πρόκληση ασυμπτωματικών βλαβών σε όργανα-στόχους, στην έκβαση του οξέος εγκεφαλικού επεισοδίου, σε ασθενείς με άλλα καρδιαγγειακά και αιματολογικά νοσήματα καθώς επίσης και στην κύηση. Η μακροχρόνια έρευνά του οδήγησε στην εισαγωγή ενός νέου δείκτη μεταβλητότητας στη διεθνή βιβλιογραφία, της ταχύτητας μεταβολής της αρτηριακής πίεσης (time rate of blood pressure variation).
- Παθοφυσιολογία Αγγειακών Εγκεφαλικών Επεισοδίων: Έρευνα πάνω στην ταξινόμηση και τη μακροχρόνια πρόγνωση ασθενών με εγκεφαλικό σε συνάρτηση με την ενδοθηλιακή λειτουργία, τις αθηροσκληρωτικές βλάβες, την κολπική μαρμαρυγή και την καρδιακή ανεπάρκεια. Διερεύνηση παθοφυσιολογικών μηχανισμών και εκβάσεων σε ασθενείς με εμβολικά εγκεφαλικά επεισόδια αδιευκρίνιστης πηγής (ESUS).